元朝领土东起日本海，南至南海，西至天山，北至贝加尔湖。《元朝史》说，“辽流沙、东至东西极、北至阴山、南越海床都在汉唐之巅之外”。
元朝的前身是大蒙古。1206年，成吉思汗·特木真成立时，他拥有沙漠的北部和南部以及林区的中心（即尼布楚地区）。经过历代蒙古汗的管理和三次西征，该领土东起日本海和东海，西至黑海和地中海，北过西伯利亚，南与波斯湾接壤。
成吉思汗时期，东西方国王分封；东边的国王是铁木真的弟弟，他们中的大多数都被分封在长城的东部和东北部；西岛的国王是铁木真的儿子，其中长子舒赤玉来自咸海、里海和巴尔喀什湖以北的秦察草甸。后来巴登建立秦察汗国；他的次子查加泰在西辽古国西洱河以北被封为查加泰哈纳托；三子窝阔台在奈曼故土被封，海都建立窝阔台汗国；长城的北部、汉族地区、东北、青藏和新疆的东部被年幼的儿子托雷收购，然后由元朝直接管理。

漠北、东北（包括东北和库页岛）、新疆东部（元初占领塔里木盆地，西至丛陵）、青藏高原、澎湖群岛、济州岛和南海诸岛均为元朝统治。南宋灭亡后，虽然与日本、缅甸、安南、爪哇等国发生过多次冲突，但领土总体趋于稳定。1310年，元朝武宗年间，元朝和察合台汗国割断了窝阔台汗国，元朝获得了窝阔台汗国的沙漠领土。
行政区划
元朝时，全国分为直辖于中书省的北京、河北地区（即河北、山东、山西和漠南部分地区），直辖于宣政院（最初称为行政院）的管区，以及兴中书的十个省，即岭北省，辽阳省、甘肃省、陕西省、河南省、湖南省、四川省、云南省、江苏省、浙江省和江西省。
藩属国
元朝的诸侯国是高丽、缅甸、安南、沾城和四个汗国。其中，有两个直属的附庸国，即缅甸的高丽王朝和巴甘王朝，它们被划分为特别行政区，占领缅甸的东部省和中部省。1268年，在西北方向，汗国窝阔台的海都试图恢复汗国的地位，并与汗国钦察和汗国察合台联合起来反对元朝，历史上称之为海都起义。
直到1304年元朝成宗年间，元与三大汗国达成和平协议，并与伊犁汗国一起承认元朝宗地位，成为元朝的附庸国。此外，元朝成宗皇帝将我国印章授予伊犁·哈纳托皇帝，称其为“真正的皇帝和避开所有外国人的宝物”，他也承认其实质上的独立性。1310年，元朝与察合台汗国共同攻打并摧毁了窝阔台汗国。元朝文宗年间，在编纂世界经典的过程中，钦差汗国、察合台汗国和伊犁汗国被列为元朝的诸侯国。

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