白马寺的本院朝南，是一个长长的院落，总面积约4万平方米。主要建筑有天王殿、大佛殿、大雄宝殿、结印殿、毗卢阁等，均列在南北方向的中轴线上。虽已不是初建时的“旧西夷天柱式”，但寺址从未动过，汉代的台地和水井依稀可见。有正殿五间，四进院落，东、西厢房。
整个寺庙布局规整，风格简洁。庙门外，广场南侧，有近年新建的石牌坊、放生池、石拱桥，左右两侧绿化。左右两匹石马，体型近似御马，形象温婉温顺。这是两匹宋代石刻马，高1.75米，长2.20米，低头承重.
相传，两匹石刻马原矗立在永庆公主（宋太祖赵匡胤之女）和右马魏贤信将军墓前，后由德杰方丈移至此白马寺的。
白马寺主体建筑位于南北中轴线上，从前到后有山门、天王殿、大佛殿、大雄宝殿、戒音殿、清凉台、毗卢阁等主要建筑。
白马寺山门采用一门三孔的拱形石拱门。 “山门”是我国佛教寺庙的正门，一般由三扇门组成，象征着佛教“空门”、“五象门”、“五座门”的“三解脱门”。由于我国古代很多寺庙都建在山村里，所以也被称为“山门”。明嘉靖二十五年（1546年）重修。红色的门楣上镶嵌着“白马寺”的青石铭文。接引殿通往清凉台的桥洞拱石上也是同样的字迹。它是东汉时期的遗物，也是白马寺的第一座古迹。山门的东西两侧分别是舍摩腾和朱翻两位僧人的坟墓。

从南到北，五个大殿分别是天王殿、大佛殿、大雄宝殿、结印殿和毗卢殿。每个殿堂都有造像，大部分是元明清时期的作品。毗卢殿位于清凉台上，舍摩腾和朱法兰翻译佛经的地方。东、西房间对称。整座建筑宏伟庄严，平面布置严谨。此外，碑上还有40多处铭文，对研究寺院历史和佛教文化具有重要价值。
天王殿为单檐歇山式，东西宽5间，南北深4间。内有明嘉湖弥勒佛像、四大天王泥塑像、魏陀天将。大佛殿为单檐歇山式。东西宽5间，南北深4间。内有佛像，文殊菩萨二，普贤菩萨，迦叶阿难二徒弟，供养二人，菩萨；
萨拉大雄为悬山式，东西宽5个海湾，南北4个深海湾。内有释迦牟尼、阿弥陀佛、药师“三佛”、韦陀、韦立、十八罗汉等23尊佛像。泥塑像等；君音殿，硬山式，三宽二深，内供奉阿弥陀佛、观音、大势至菩萨二尊；毗卢阁，歇山式重檐，坐落在美丽的平台上，东西宽5间，南北深4间。内有毗卢遮那、文殊菩萨、普贤菩萨二尊。
钟鼓楼分别位于山门中南中轴线的东西两侧。钟楼于1991年6月由日本村宝兴先生捐资400万日元，白马寺捐资60万元建成。鼓楼于1992年落成。钟楼、坦布罗楼均为方形角楼，高7米，重檐歇山式，覆灰筒瓦，正面彩绘，建于石台之上。钟鼓楼的建成恢复了寺院晨钟鼓的佛教仪式，并恢复了历史悠久的洛阳八景之一：“马寺钟声”。
白马寺钟鼓楼、法宝阁、经阁分别位于清凉台的东西两侧。 1995年竣工，两阁造型一致，斜山式重檐，朝南，宽5间，进深4间，长18.5米，宽12.95米，红漆柱，正面彩绘，灰筒瓦。
其中，藏经阁供奉泰国佛教界在白马寺供奉的我国古代佛像，收藏了龙大藏经、我国大藏经、日本大藏经、大藏经、和敦煌大藏经；里面的法宝阁是1993年印度总理饶先生访华时赠送的一尊铜佛像，馆内藏有数十件“法宝”。
泰式佛寺，位于寺院西墙外100米处，始建于1992年，1995年4月竣工。大殿自西向东，建于长27、3米的平台上，宽21.3米，高1.2米。正殿南北长14.4米，东西宽7.5米，高10米。风格。房间里有一位泰国朋友赠送的青铜佛像。
玉卧佛殿位于大佛殿东侧，原为斋堂，始建于1996年。殿为五跨山式建筑，南北长17.25米，宽东西长5.4米。

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